La Direction de Ports pour petits bateaux (PPB), Régions des Maritimes et du Golfe, comprend les provinces du Nouveau-Brunswick, de la Nouvelle-Écosse et de l’Île-du-Prince-Édouard.
La gestion des sites de PPB dans ces trois provinces est divisée en six secteurs, chacun dirigé par un Gestionnaire de secteur et un ou plusieurs Gestionnaires des opérations avec le soutient du personnel du bureau régional situé à Moncton.
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La variété est sans doute ce qui caractérise le mieux le secteur de l’Est du Nouveau-Brunswick, aussi bien dans ses aspects géographiques que dans les types de pêche qu’on y pratique. Situé sur le Golfe du Saint-Laurent, ce secteur abrite des zones côtières rocheuses aussi bien que sablonneuses. C’est dans l’Est du Nouveau-Brunswick que l’on retrouve la plus importante flottille semi-hauturière du golfe du Saint-Laurent, pêchant le crabe des neiges et le hareng. La pêche côtière reste toutefois la plus importante de ce secteur. Les marées sont modérées et la présence de glace limite grandement l’activité en hiver. Le tourisme est une industrie importante dans ce secteur et les pêcheurs cohabitent avec des navires de plaisance pendant l’été. Dans ce secteur on retrouve 42 administrations portuaires, gérant 43 sites de PPB.



Le secteur du sud du Nouveau-Brunswick est entièrement situé dans la baie de Fundy, célèbre de par le monde en raison de ses marées spectaculaires qui peuvent atteindre 10 mètres. Les ports et quais de ce secteur subissent l’influence de ces marées, ce qui se reflète dans leur architecture et leurs dimensions. La pêche au homard et l’aquaculture du saumon sont les activités les plus importantes et génèrent beaucoup de circulation sur les quais de ce secteur. La baie de Fundy n’étant que peu affectée par les glaces, les quais y sont occupés pendant toute l’année. Dans ce secteur, 14 administrations portuaires gèrent 28 sites de PPB.



Le secteur du Golfe – Nouvelle-Écosse inclut les côtes de la Nouvelle-Écosse donnant sur le Golfe du Saint-Laurent, depuis la frontière du Nouveau-Brunswick jusqu’à Bay St Lawrence, à la pointe nord du Cap-Breton. Le littoral est uniforme avec des côtes sablonneuses et rocheuses et des marées modérées. Les ports de ce secteur ne sont pas utilisés pendant l’hiver, le Golfe du Saint-Laurent étant alors recouvert de glace. Ce secteur comprend une importante pêche côtière et une pêche semi-hauturière du crabe des neiges et du hareng à partir de Chéticamp, le plus gros port dans le secteur. Des bateaux d’autres provinces pêchant le crabe utilisent ce port. Certaines parties du secteur voient actuellement une augmentation du nombre d’entreprises d’observation des baleines. Dans ce secteur on retrouve 30 administrations portuaires gérant 33 sites.



Le secteur de l’est de la Nouvelle-Écosse regroupe principalement des ports de la côte néo-écossaise donnant sur l’océan Atlantique, en plus de quelques quais dans la baie de Fundy. On trouve des conditions géographiques et maritimes variées dans ce vaste secteur. La plupart des ports sont sujets aux glaces en hiver et l’activité aux quais est saisonnière, à l’exception des ports de la baie de Fundy, ouverts toute l’année. Ce secteur est principalement constitué de petits quais dévoués à la pêche côtière. On retrouve toutefois des ports plus importants en taille sur l’île du Cap-Breton. Dans ce secteur, 34 administrations portuaires gèrent 41 sites de Ports pour petits bateaux.



Le secteur du sud-ouest de la Nouvelle-Écosse présente deux visages différents. D’un côté, la baie de Fundy et ses fortes marées jusqu'à 10 m et de l’autre, l’océan Atlantique à l’amplitude plus modérée. Ces deux zones ont en commun des côtes rocheuses et des eaux libres de glaces la plupart de l’année. D’une façon générale, les quais de ce secteur sont en activité toute l’année supportant de nombreuses pêches telle la pêche du homard, la pêche semi-hauturière des poissons de fond, du pétoncle et du hareng ainsi que l’aquaculture du saumon. On retrouve 71 administrations portuaires, qui gèrent 91 sites dans ce secteur.



L’Île-du-Prince-Édouard est située dans le Golfe du Saint-Laurent, séparée du Nouveau-Brunswick et de la Nouvelle-Écosse par le détroit de Northumberland. C’est un secteur dans lequel on trouve de nombreuses baies sablonneuses et peu profondes. Les marées, entre 0,6 et 2,7 mètres (2 à 9 pieds), ont une influence limitée sur les structures, mais les courants qu’elles causent et les déplacements de sable qui en résultent demandent régulièrement des travaux de dragage pour rendre praticables certains chenaux. L’habitat marin du secteur est très favorable au homard, et on y pratique une importante pêche côtière. Les eaux de l’Île-du-Prince-Édouard hébergent également d’importantes exploitations aquacoles de moules bleues et d’huîtres dans les baies peu profondes et riches en nutriments. L’activité commerciale sur les quais est concentrée pendant l’été et l’automne, le Golfe du Saint-Laurent étant recouvert de glace durant l’hiver. Dans ce secteur, il y a 42 administrations portuaires, qui gèrent 46 sites.